Dans Kyoto no Neko, 2 à 4 joueurs incarnent des chatons qui explorent la ville moderne de Kyoto, au Japon, à travers une série de scénarios indépendants et rejouables. Dans chaque scénario, les joueurs doivent remplir diverses missions, qu'il s'agisse de se lier d'amitié avec un écolier, de combattre un chat errant agressif ou de voler la nourriture dans la gamelle d'un autre joueur. Tout au long du jeu, chaque joueur évolue, développe ses compétences et acquiert la capacité d'explorer de nouvelles parties de la carte en grimpant sur les buissons et les toits.

Grâce à un système de compétences, Kyoto no Neko permet à chaque joueur d'interagir avec les habitants de Kyoto, qu'ils soient humains ou animaux. Chaque tour offre l'opportunité de découvrir quelque chose de nouveau sur la ville, les joueurs révélant des éléments allant de petits insectes à des objets spécifiques ou à des habitants de Kyoto. Certains de ces éléments sont représentés par des tuiles en carton, tandis que d'autres sont représentés par des figurines, ce qui leur confère une présence visuelle étonnante.